La conquista del Perú
Francisco Pizarro, socio de Diego Almagro, sale de Panamá en 1531 rumbo al sur, llegado a la costa del Perú, con casi dos centenas de hombre y una treintena de caballos. En Cajamarca vence a los incas (1532) y ordena la muerte de Atahuallpa.
Ordenan a ejecutar al Inca Atahuallpa, el cual para que se le condone la pena ofrece un cuarto lleno de oro hasta la altura de su brazo, a pesar de haber pagado el rescate Atahuallpa fue condenado a sufrir la pena del garrote, posteriormente en circunstancias no esclarecidas con precisión, Atahuallpa es asesinado.
En el año 1533 Almagro llega al Cuzco con refuerzos donde conjuntamente con Pizarro organizan la capital del incanato con corregidores y alcaldes, hasta que en el año 1536 Pizarro funda la ciudad de los Reyes (Lima).
Anoticiado el Emperador Carlos V de esta conquista, divide el territorio en dos partes, una para Almagro que se denomino Nueva Toledo y otra para Pizarro que se denomino Nueva Castilla, pero las desaveniencias entre ambos hicieron que Pizarro proponga a Almagro la exploración de la parte meridional.
Los hombres de éste, al mando de Juan de Saavedra, penetran en el actual territorio de Bolivia fundando Paria y Tupiza. La conquista dio lugar a grandes abusos por lo que se emiten las Ordenanzas de Barcelona que iban dirigidas a reprimir los abusos.
Los conquistadores piden a Gonzalo Pizarro, que entonces se hallaba en Porco, que los encabezase en contra de las disposiciones del rey. Conocida en España la rebelión pizarrista el Emperador envió al Perú a Pedro de la Gasca quien derrotó a Gonzalo Pizarro.
Durante varios años la lucha entre Pizarro y Almagro por el poder en el Perú mantuvo ocupados a los españoles y demoró la conquista del Callao. Derrotado Almagro fue hecho prisionero y degollado en la Plaza del Cuzco en 1538. Francisco Pizarro ordenó a Pedro Anzures de Campo Redondo seguir al Sur. Anzures fundó a Charcas (set. 29, 1538), más tarde conocida como La Plata. Chuquisaca, y finalmente Sucre.
En 1540 Pizarro extendió a estos territorios el sistema de las encomiendas. En 1549, Ñuflo de Chávez llegó a las selvas del Gran Chaco y pasó al Paraguay.
En medio de varias guerras civiles sucedió el acontecimiento más importante del Alto Perú que fue el descubrimiento de los ricos yacimientos de plata en el cerro de Potosí, por el pastor indio Diego Huallpa en el año 1545 (abril, 10), esta noticia fue conocida en el Perú, la cual atrajo a muchos conquistadores en pos de estas riquezas.
Este descubrimiento le otorgó un fama mundial por su incalculable riqueza. Durante los tres siglos de dominación española, la Corona recibió 3.600 millones de pesos de plata por derechos mineros en Potosi.
En 1580 la Villa Imperial de Potosí adquirió un gran esplendor donde se encontraba todo tipo de productos pero sus construcciones eran pobres y de mal aspecto. Desde el año 1582 empiezan las guerras civiles entre Vicuñas y Vascongados, por luchas de primacías y emulaciones.
Desde 1603 los combates recrudecen hasta que en 1611 el Virrey Conde de Montesclaros realiza el primer censo en la población de Potosí cuyo resultado da un total de 160.000 habitantes de los cuales 66.000 eran indios, 40.000 españoles peninsulares, 3.000 españoles de Potosí, 35.000 españoles de América y 6.000 negros.